More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3925 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  79.87 
 
 		 488 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 501 aa  1006    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  79.75 
 
 		 495 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  79.92 
 
 		 494 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  79.92 
 
 		 494 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  79.87 
 
 		 488 aa  711    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  79.87 
 
 		 488 aa  711    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.12 
 
 		 494 aa  723    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.65 
 
 		 493 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  77.66 
 
 		 495 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.09 
 
 		 499 aa  802    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  96.41 
 
 		 500 aa  921    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  79.87 
 
 		 488 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.42 
 
 		 494 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  78.85 
 
 		 494 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.65 
 
 		 494 aa  716    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.65 
 
 		 494 aa  716    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  78.42 
 
 		 494 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  47.45 
 
 		 542 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 560 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 557 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  40.61 
 
 		 557 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.16 
 
 		 513 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.89 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 531 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 524 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34 
 
 		 509 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.37 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.58 
 
 		 526 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 515 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 517 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.84 
 
 		 517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 515 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.26 
 
 		 499 aa  213  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 519 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 517 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.97 
 
 		 517 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 487 aa  209  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 518 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.62 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 452 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.29 
 
 		 515 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.75 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 505 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  34.13 
 
 		 506 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  38.86 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  38.86 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 478 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.67 
 
 		 438 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  38.79 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 481 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 484 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 482 aa  196  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  32.6 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  31.43 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.13 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.13 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 445 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  32.37 
 
 		 496 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 472 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  38.92 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  30.67 
 
 		 467 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  30.74 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  33.8 
 
 		 481 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 469 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.84 
 
 		 438 aa  180  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 455 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.32 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  29.94 
 
 		 495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  37 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  30.27 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.5 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>