More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3553 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 557 aa  1102    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  96.05 
 
 		 557 aa  1017    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.43 
 
 		 560 aa  522  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  56.93 
 
 		 542 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  42.16 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.97 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 		 494 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  41.68 
 
 		 495 aa  319  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  41.68 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  41.79 
 
 		 494 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  41.22 
 
 		 488 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  41.03 
 
 		 495 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 500 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 499 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 501 aa  301  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.72 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.65 
 
 		 480 aa  210  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.53 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  39.64 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.91 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 515 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.21 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  30.92 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 524 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 515 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.04 
 
 		 523 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  31.61 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 519 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 517 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  33.4 
 
 		 506 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 433 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 505 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  34.33 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 487 aa  194  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 505 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 505 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 448 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 505 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 517 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.22 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 517 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  30.02 
 
 		 517 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  40.48 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.89 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  40.66 
 
 		 438 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 471 aa  183  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  32.46 
 
 		 467 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  40.63 
 
 		 438 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  40.4 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 493 aa  178  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 452 aa  178  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 465 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 482 aa  177  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3980  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.993418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  29.92 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  28.46 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  35.88 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  32.08 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 439 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.33 
 
 		 433 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  34.32 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 455 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  35.43 
 
 		 496 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  34.56 
 
 		 439 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 460 aa  171  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.68 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.09 
 
 		 472 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  32.12 
 
 		 474 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>