More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2007 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
448 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.73 
 
 
433 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.96 
 
 
448 aa  825    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.76 
 
 
445 aa  835    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  87.91 
 
 
438 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.43 
 
 
448 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  100 
 
 
448 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
448 aa  880    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  88.37 
 
 
438 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.98 
 
 
445 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  738    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  87.91 
 
 
438 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  76.96 
 
 
433 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  76.04 
 
 
433 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  49.89 
 
 
444 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  50.91 
 
 
438 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  50.46 
 
 
438 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.46 
 
 
438 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  50.34 
 
 
443 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.93 
 
 
454 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  42.79 
 
 
442 aa  296  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
444 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
444 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
475 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
453 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
461 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
458 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  39.91 
 
 
487 aa  260  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
458 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
466 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
450 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  38.6 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  40.34 
 
 
441 aa  253  6e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
456 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
459 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
459 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
459 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
459 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  38.37 
 
 
1093 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
455 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
455 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  37.73 
 
 
455 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  43.22 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  37.75 
 
 
449 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
445 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  36.51 
 
 
449 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  35.93 
 
 
439 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
439 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.07 
 
 
446 aa  216  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  34.22 
 
 
471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  33.98 
 
 
471 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
458 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
446 aa  210  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.12 
 
 
513 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
471 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.41 
 
 
526 aa  206  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
481 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  46.08 
 
 
471 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  33.41 
 
 
446 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
531 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
442 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  35.68 
 
 
478 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  35.68 
 
 
478 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
443 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
487 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 
517 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
505 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
505 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  40.97 
 
 
517 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 
478 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 
519 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.95 
 
 
467 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
472 aa  199  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  37.75 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  40.72 
 
 
523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  40.07 
 
 
518 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
515 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
515 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  39.75 
 
 
463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  39.76 
 
 
499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
465 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
524 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  33.64 
 
 
459 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  29.59 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  34.79 
 
 
457 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  40.07 
 
 
817 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  34.14 
 
 
457 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>