More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3681 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  885    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.28 
 
 		 450 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.06 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.2 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 		 438 aa  329  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.24 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 		 446 aa  322  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 453 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.29 
 
 		 444 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 		 445 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  43.37 
 
 		 463 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 		 446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 449 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.68 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.41 
 
 		 471 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.58 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  38.73 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  38.73 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  38.73 
 
 		 438 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  33.05 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.95 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  32.17 
 
 		 519 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  36.96 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  36.89 
 
 		 475 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  36.63 
 
 		 505 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  36.63 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  36.63 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  36.3 
 
 		 518 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 517 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  26.52 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  35.19 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 448 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 519 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.07 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 515 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  36.21 
 
 		 817 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 531 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.79 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.17 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.17 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  36.6 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  33.87 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.1 
 
 		 515 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  38.41 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  36.39 
 
 		 517 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  35.64 
 
 		 517 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 515 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3934  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 441 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 454 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.55 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  36.31 
 
 		 518 aa  158  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  36.07 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  32.39 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.2 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 449 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>