More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3934 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3934  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 441 aa  883    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.07 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.79 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.61 
 
 		 440 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2758  two-component sensor  69.7 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32570  two-component sensor  69.7 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 441 aa  305  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2383  histidine kinase A-like protein  40.62 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00184355  hitchhiker  0.0000213821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4238  histidine kinase  39.28 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0372163  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 486 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1413  histidine kinase  36.31 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 453 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  31.78 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  34.42 
 
 		 455 aa  189  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.96 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.96 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.66 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.96 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.66 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.73 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 438 aa  179  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  32.65 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3434  sensor protein QseC  34.52 
 
 		 449 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  32.9 
 
 		 467 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3529  sensor protein QseC  34.52 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3428  sensor protein QseC  34.3 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3359  sensor protein QseC  34.3 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3363  sensor protein QseC  34.3 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.987162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  32.94 
 
 		 467 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  33.1 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  29.94 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  34.32 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  31.88 
 
 		 471 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 454 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  31.64 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  31.02 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3430  sensor protein QseC  33.18 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  32.29 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.43 
 
 		 457 aa  156  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  30.63 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 438 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  31.51 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.54 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 462 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.54 
 
 		 478 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  32.51 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  31.32 
 
 		 499 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63160  PmrB: two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  34.29 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  34.59 
 
 		 506 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  30.34 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  32.97 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  33.42 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>