More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5865 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.66 
 
 
462 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  899    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.93 
 
 
458 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.33 
 
 
449 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.51 
 
 
450 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 
450 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  51.91 
 
 
475 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  43.33 
 
 
519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  37.76 
 
 
449 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  36.56 
 
 
478 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  36.56 
 
 
478 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  36.32 
 
 
471 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  36.05 
 
 
471 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
444 aa  219  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  32.8 
 
 
457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.96 
 
 
438 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  33.05 
 
 
449 aa  209  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4531  sensor protein QseC  33.83 
 
 
449 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0682388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
457 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
433 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
480 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.91 
 
 
455 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  33.4 
 
 
467 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  29.35 
 
 
467 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34.27 
 
 
459 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
438 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
438 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
438 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
438 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.31 
 
 
438 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
445 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.09 
 
 
438 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
438 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  41.28 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
448 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
467 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35.5 
 
 
442 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
461 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4178  sensor protein QseC  36.18 
 
 
449 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.64 
 
 
501 aa  193  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
438 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
433 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
445 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
441 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
466 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
454 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
471 aa  190  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  34.31 
 
 
472 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
453 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.71 
 
 
433 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.96 
 
 
449 aa  187  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
413 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  33.18 
 
 
449 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3430  sensor protein QseC  34.45 
 
 
448 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.89 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.74 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.74 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.74 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
450 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.74 
 
 
449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.3 
 
 
454 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.67 
 
 
449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
454 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.54 
 
 
457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.52 
 
 
449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.62 
 
 
513 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
448 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  34.8 
 
 
448 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  33.65 
 
 
467 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
454 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
448 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  33.49 
 
 
454 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
438 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
517 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3428  sensor protein QseC  34.57 
 
 
449 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63160  PmrB: two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  33.41 
 
 
477 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
524 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
515 aa  180  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3529  sensor protein QseC  34.35 
 
 
449 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.74 
 
 
526 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
448 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
505 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
515 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
505 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
505 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2077  signal transduction histidine kinase sensor  29.27 
 
 
487 aa  179  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200991  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.45 
 
 
505 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.41 
 
 
492 aa  179  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
462 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3434  sensor protein QseC  34.35 
 
 
449 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
446 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
455 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.76 
 
 
523 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>