More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1076 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  870    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.05 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.82 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.27 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.94 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  53.29 
 
 		 463 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.53 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 453 aa  335  9e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  48.52 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 		 450 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 		 450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  36.68 
 
 		 449 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  34.47 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  34.21 
 
 		 471 aa  213  7.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.96 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.96 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.96 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.96 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  35.69 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  35.69 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32.74 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.51 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 455 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.29 
 
 		 449 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 450 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.97 
 
 		 455 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 452 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 445 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 445 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 441 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  32.24 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.88 
 
 		 442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 454 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  34.92 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 452 aa  176  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.74 
 
 		 454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  34.5 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 475 aa  173  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  31.75 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  30.43 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.67 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  30.21 
 
 		 519 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  29.62 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 467 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 454 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  33.11 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  37.13 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.24 
 
 		 499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4531  sensor protein QseC  29.62 
 
 		 449 aa  167  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0682388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  33.62 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  33.97 
 
 		 455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 505 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 518 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 440 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.82 
 
 		 501 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  31.87 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>