More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3457 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 
453 aa  902    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.72 
 
 
454 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.68 
 
 
444 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  43.27 
 
 
438 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  43.05 
 
 
438 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  43.05 
 
 
438 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
445 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
448 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  43.02 
 
 
448 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
448 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
448 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  37.5 
 
 
442 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.03 
 
 
433 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 
433 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  41.01 
 
 
444 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  42.73 
 
 
438 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  40.23 
 
 
443 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
438 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  41.39 
 
 
438 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
444 aa  243  7e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
475 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
450 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  37.89 
 
 
441 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
466 aa  226  8e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
458 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
461 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  34.32 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  36.38 
 
 
487 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
459 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  33.26 
 
 
1093 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
449 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
456 aa  203  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  39.37 
 
 
442 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.79 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  36.18 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
466 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
446 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
431 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
439 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
442 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  33.5 
 
 
478 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  33.5 
 
 
478 aa  190  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
452 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  34.55 
 
 
439 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.52 
 
 
446 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
453 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
505 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
450 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.56 
 
 
499 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
517 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
505 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
449 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.23 
 
 
505 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  39.61 
 
 
523 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.05 
 
 
513 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
519 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
515 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  33.49 
 
 
452 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
515 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.39 
 
 
526 aa  177  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  32.55 
 
 
454 aa  176  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  29.8 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  29.8 
 
 
471 aa  176  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  38.64 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  32.81 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  38.96 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  31.15 
 
 
457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  38.96 
 
 
817 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  37.23 
 
 
518 aa  173  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  34.24 
 
 
435 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  30.87 
 
 
457 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.22 
 
 
517 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
435 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  32.19 
 
 
449 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
445 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
517 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
515 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
517 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
454 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
524 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>