More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3111 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 442 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.36 
 
 		 445 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 437 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  37.53 
 
 		 438 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  37.33 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  37.33 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  37.36 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 439 aa  235  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  41.26 
 
 		 439 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  41.02 
 
 		 446 aa  229  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  40.92 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  37.2 
 
 		 471 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 448 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  36.1 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 448 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  33.71 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  33.65 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.78 
 
 		 433 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.21 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 454 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  36.22 
 
 		 449 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  35.68 
 
 		 459 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  32.59 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  35.58 
 
 		 1093 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 458 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 474 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  37.53 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  33.18 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  30.32 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  32.93 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  32.93 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 480 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 450 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  34.73 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.56 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 453 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 446 aa  182  7e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  34.05 
 
 		 455 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  33.48 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  32.57 
 
 		 471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  32.57 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.88 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  36.43 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.38 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.47 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 450 aa  172  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  35.69 
 
 		 526 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 524 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  34.88 
 
 		 519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  34.6 
 
 		 454 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>