More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2297 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  100 
 
 		 471 aa  938    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.02 
 
 		 443 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.02 
 
 		 443 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  76.02 
 
 		 443 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.64 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.36 
 
 		 439 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  60.23 
 
 		 439 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.2 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  57.84 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.24 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 446 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  41.53 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  42.25 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 441 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  36.38 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 448 aa  226  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  36.38 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  36.32 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 445 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.26 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 448 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 444 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  35.59 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 466 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  33.12 
 
 		 1093 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 456 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  34.25 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 454 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.62 
 
 		 499 aa  189  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 480 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.71 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  35.25 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.79 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 517 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 515 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.82 
 
 		 513 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  34.09 
 
 		 468 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.63 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  36.36 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 531 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 524 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  33.48 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 517 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.06 
 
 		 526 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 517 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.37 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.56 
 
 		 523 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 482 aa  176  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.51 
 
 		 817 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 515 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  35.4 
 
 		 517 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  31.75 
 
 		 454 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  33.51 
 
 		 495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  33.54 
 
 		 467 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 505 aa  173  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>