More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4166 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 445 aa  888    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.9 
 
 		 442 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 437 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  36.55 
 
 		 438 aa  237  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  36.53 
 
 		 438 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  36.53 
 
 		 438 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  37.73 
 
 		 446 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 448 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 445 aa  229  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 439 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  39.71 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  36.98 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 448 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3294  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  38.37 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 474 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.64 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.67 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 443 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 446 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 480 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  34.06 
 
 		 467 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4099  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 450 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 466 aa  189  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 458 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  31.7 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  33.41 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  33.68 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 461 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36.32 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  31.32 
 
 		 1093 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2714  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  29.49 
 
 		 467 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.05 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 454 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.98 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  31.03 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  35.07 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  32.01 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  30.81 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.87 
 
 		 499 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  32.76 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  32.76 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.01 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.01 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 531 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  33.51 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.44 
 
 		 526 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.65 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  30.4 
 
 		 473 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  33.25 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  29.06 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 452 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 515 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  32.42 
 
 		 518 aa  156  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>