More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2599 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2599  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
450 aa  899    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0620227 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  53.24 
 
 
471 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 
443 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 
443 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.91 
 
 
443 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.23 
 
 
480 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  48.53 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 
439 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5020  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.11 
 
 
474 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323054  normal  0.120297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  48.32 
 
 
446 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
446 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  39.3 
 
 
446 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  40.76 
 
 
435 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
435 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
437 aa  259  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
443 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.37 
 
 
442 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
444 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
475 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
445 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  36.52 
 
 
454 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
458 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
466 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
458 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
449 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
524 aa  176  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
441 aa  176  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  32.03 
 
 
455 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
461 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  39.13 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  39.13 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
505 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  32.78 
 
 
487 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
505 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
505 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  38.8 
 
 
505 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  35.67 
 
 
444 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
433 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  39.13 
 
 
817 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
442 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.217081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
454 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  169  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
459 aa  169  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
456 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.48 
 
 
433 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
438 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
471 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  31.67 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
445 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
448 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
445 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  38.18 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  32.81 
 
 
1093 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  38 
 
 
517 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4982  histidine kinase  40.85 
 
 
467 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305524  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 
517 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
515 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.1 
 
 
526 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.91 
 
 
499 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.11 
 
 
443 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  36.1 
 
 
495 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
433 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.26 
 
 
515 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.48 
 
 
513 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
519 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
481 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  31.47 
 
 
449 aa  159  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  40.64 
 
 
473 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.11 
 
 
463 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.49 
 
 
449 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  37.2 
 
 
483 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
515 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  33.23 
 
 
471 aa  157  4e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
515 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  33.23 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
487 aa  156  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3980  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
542 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.993418  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  30.25 
 
 
501 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
450 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  35.42 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
468 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>