More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1594 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
523 aa  1016    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  51.67 
 
 
524 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  49.56 
 
 
471 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  43.71 
 
 
542 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  48.25 
 
 
476 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  45.4 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
484 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  50.55 
 
 
449 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.02 
 
 
515 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 
478 aa  319  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 
482 aa  316  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.36 
 
 
675 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  43.82 
 
 
504 aa  291  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  40.43 
 
 
472 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.45 
 
 
464 aa  279  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 
543 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 
526 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
482 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  44.77 
 
 
529 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  43.63 
 
 
566 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  46.69 
 
 
451 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
491 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  34.85 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  34.71 
 
 
462 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
479 aa  187  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
469 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  35.1 
 
 
463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
504 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
459 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.5 
 
 
481 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.34 
 
 
477 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
469 aa  158  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
474 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  37.54 
 
 
518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
518 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.1 
 
 
466 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.28 
 
 
490 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
466 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  32.29 
 
 
462 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.72 
 
 
593 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
470 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
458 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.98 
 
 
473 aa  144  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.24 
 
 
512 aa  144  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
565 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
488 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.69 
 
 
467 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.23 
 
 
463 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
469 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  39.93 
 
 
594 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  32.9 
 
 
450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.38 
 
 
470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.56 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  36.96 
 
 
478 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
507 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.14 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  31.66 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.64 
 
 
463 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.69 
 
 
470 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
469 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
382 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  33.76 
 
 
449 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.2 
 
 
446 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
490 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0982  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  36.04 
 
 
467 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.363235  normal  0.539382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
524 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.67 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
463 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.97 
 
 
463 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.94 
 
 
467 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.94 
 
 
467 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
467 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
452 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
436 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
450 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.67 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  35.94 
 
 
467 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  35.94 
 
 
467 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.94 
 
 
467 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  35.94 
 
 
467 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  35.94 
 
 
467 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
515 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  31.44 
 
 
397 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.46 
 
 
456 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  34.27 
 
 
471 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
500 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  33.78 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.33 
 
 
460 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.52 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.39 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
469 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>