More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4520 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 471 aa  932    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  46.84 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  49.03 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.88 
 
 		 523 aa  352  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 		 478 aa  349  5e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  47.62 
 
 		 498 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  41.92 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  42.26 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  40.09 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.84 
 
 		 464 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.76 
 
 		 482 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 675 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  48.42 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  49.4 
 
 		 529 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.55 
 
 		 543 aa  243  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.16 
 
 		 526 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  38.9 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  38.64 
 
 		 462 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  49.81 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 491 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 479 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.42 
 
 		 481 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 474 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.82 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 469 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.01 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  31.86 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 473 aa  152  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  31.42 
 
 		 397 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.9 
 
 		 463 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.14 
 
 		 490 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 469 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  31.51 
 
 		 559 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.83 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  36.54 
 
 		 478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 517 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 463 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 473 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 470 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  41.47 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  35.03 
 
 		 529 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  30.25 
 
 		 471 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  37.88 
 
 		 343 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 475 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.88 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.88 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.88 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3556  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.31 
 
 		 460 aa  143  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  37.91 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 490 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  36.65 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  27.92 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.67 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.47 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  31.19 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  28.22 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 484 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 534 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  36.34 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  36.34 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 458 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  36.04 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0411484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4831  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.540508  normal  0.671579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  30.08 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 455 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  30.08 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  34.88 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  30.08 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  30.08 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>