More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5197 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 491 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  56.55 
 
 		 479 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  44.69 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  44.47 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  34.01 
 
 		 524 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  36.65 
 
 		 566 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.41 
 
 		 523 aa  197  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  40 
 
 		 542 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  36.86 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  39.26 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 675 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.39 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 449 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  38.12 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  33.98 
 
 		 498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 		 526 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 484 aa  163  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  43.04 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  37.5 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  41.76 
 
 		 451 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.27 
 
 		 486 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  38.31 
 
 		 466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.43 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.03 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.13 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 504 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.6 
 
 		 466 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.52 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  37.1 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 524 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  33.81 
 
 		 473 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  28.11 
 
 		 482 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3034  histidine kinase  31.67 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 365 aa  120  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  32.25 
 
 		 450 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  31.73 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  26.42 
 
 		 497 aa  119  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.37 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 471 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.8 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 473 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  30.29 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.77 
 
 		 469 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.92 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.61 
 
 		 458 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  32.25 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.07 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.49 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.49 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  25.81 
 
 		 471 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  36.71 
 
 		 444 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  33.47 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.39 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  34.74 
 
 		 508 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 436 aa  113  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  25.81 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 515 aa  113  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 435 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  34.5 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  33.99 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  28.31 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>