More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0467 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  100 
 
 
451 aa  885    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  38.75 
 
 
524 aa  250  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.69 
 
 
523 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.98 
 
 
478 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  39.04 
 
 
566 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  47.46 
 
 
542 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.35 
 
 
482 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  37.26 
 
 
498 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  37.08 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  49.65 
 
 
471 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.53 
 
 
464 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  38.41 
 
 
476 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
675 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  41.95 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  49.32 
 
 
529 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  39.62 
 
 
462 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
515 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 
482 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
484 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  47.7 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
526 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  35.56 
 
 
504 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
479 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
491 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
515 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
469 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
474 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.49 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
500 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  28.85 
 
 
490 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  35.63 
 
 
423 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.78 
 
 
496 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.69 
 
 
477 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
425 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  28.69 
 
 
484 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
518 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  33.52 
 
 
518 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  35.38 
 
 
441 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
473 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  28.83 
 
 
484 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  37.5 
 
 
363 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
487 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.67 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  28.83 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  37 
 
 
455 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.13 
 
 
512 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
467 aa  136  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  31.06 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.84 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  28.53 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.15 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
466 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
490 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  35.07 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.53 
 
 
467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  30.38 
 
 
463 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.9 
 
 
499 aa  133  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1202  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.9 
 
 
452 aa  133  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 
455 aa  132  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  31.83 
 
 
452 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.86 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.4 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  29.56 
 
 
484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  31.83 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  31.83 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  38.55 
 
 
505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.22 
 
 
453 aa  131  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.22 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
509 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
495 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  34.56 
 
 
450 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.1 
 
 
463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.86 
 
 
1162 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.48 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  36.16 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  24.85 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  35.02 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  29.1 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.17 
 
 
472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
455 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>