More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1156 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 526 aa  1015    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.89 
 
 		 675 aa  533  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.6 
 
 		 523 aa  302  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  41.8 
 
 		 524 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  39.04 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  39.38 
 
 		 542 aa  273  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 478 aa  272  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  46.8 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  41.58 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  39.81 
 
 		 498 aa  269  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.48 
 
 		 543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  49.21 
 
 		 464 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 484 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 482 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 449 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  39.33 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 515 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  42.33 
 
 		 476 aa  229  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  38.48 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  36.62 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  36.62 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 491 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 479 aa  196  9e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  42.5 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.46 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 504 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.64 
 
 		 486 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 532 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  40 
 
 		 517 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 459 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.41 
 
 		 481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  30.09 
 
 		 472 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.02 
 
 		 466 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  30.45 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 474 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.28 
 
 		 461 aa  144  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 490 aa  143  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  38.49 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.7 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  32.11 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.81 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 491 aa  140  7e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 469 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  32.97 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  35.81 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54833  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 464 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  28.09 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 495 aa  136  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 471 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.34 
 
 		 503 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  35.38 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.51 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 522 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  35.59 
 
 		 508 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 468 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  38.59 
 
 		 476 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 466 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 489 aa  134  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  34.88 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  34.88 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.66 
 
 		 490 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  32.49 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  34.75 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.99 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 396 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 473 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>