More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3940 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.62 
 
 
532 aa  1028    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.42 
 
 
517 aa  997    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.13 
 
 
534 aa  677    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
532 aa  1031    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.04 
 
 
546 aa  611  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  62.75 
 
 
506 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  53.28 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  53.74 
 
 
494 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  54.21 
 
 
477 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  53 
 
 
473 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
612 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.08 
 
 
552 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  44 
 
 
497 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.27 
 
 
509 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
510 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  44.2 
 
 
526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  41.86 
 
 
494 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 
502 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  42.92 
 
 
469 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
515 aa  253  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.97 
 
 
479 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
524 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
522 aa  239  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  42.98 
 
 
477 aa  237  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5254  histidine kinase  44.24 
 
 
545 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118583  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11050  two component system sensor histidine kinase trcS  39.02 
 
 
509 aa  223  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.23 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
474 aa  217  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  40.7 
 
 
492 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  40.43 
 
 
487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
601 aa  212  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
545 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.63 
 
 
486 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
500 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
502 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
473 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
473 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
473 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
529 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  40.32 
 
 
477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
635 aa  197  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.5 
 
 
503 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  40.83 
 
 
469 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  35.44 
 
 
503 aa  196  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  40 
 
 
520 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
528 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
535 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
501 aa  193  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  42.3 
 
 
467 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
505 aa  191  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
488 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  40.53 
 
 
470 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  35.87 
 
 
540 aa  191  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22040  signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
428 aa  190  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  42.49 
 
 
550 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
459 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  36.06 
 
 
496 aa  186  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  39.11 
 
 
488 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  39.88 
 
 
471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  35.6 
 
 
485 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
468 aa  180  7e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
504 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  37.67 
 
 
559 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
365 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
471 aa  174  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  34.99 
 
 
648 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
504 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  33 
 
 
474 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
509 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.86 
 
 
490 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.67 
 
 
486 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  37.57 
 
 
508 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.14 
 
 
447 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
480 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.65 
 
 
477 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
469 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
468 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  42.09 
 
 
505 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
464 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  34.39 
 
 
494 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
815 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
490 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.06 
 
 
496 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  29.23 
 
 
418 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.52 
 
 
468 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
491 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  35.4 
 
 
475 aa  152  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
425 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
384 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  39.84 
 
 
481 aa  150  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.92 
 
 
466 aa  150  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
477 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
389 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
534 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
452 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
473 aa  147  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>