More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2109 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2109  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
510 aa  989    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.11 
 
 
457 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  41.26 
 
 
450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  40.27 
 
 
450 aa  264  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
469 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.370323  normal  0.370288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4038  histidine kinase  42.03 
 
 
451 aa  240  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0685661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  38.41 
 
 
469 aa  234  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  31.29 
 
 
505 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
575 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  31.89 
 
 
567 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
552 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
555 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
555 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.35 
 
 
468 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  31.34 
 
 
594 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
352 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
547 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
515 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
515 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
515 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
496 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  32.11 
 
 
557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  38.3 
 
 
504 aa  141  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  32.92 
 
 
554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  36.81 
 
 
557 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  30.4 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
539 aa  140  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  37.34 
 
 
508 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
526 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  35.48 
 
 
469 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  32.99 
 
 
544 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  33.62 
 
 
475 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  32.96 
 
 
587 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
478 aa  136  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  30.91 
 
 
594 aa  136  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
605 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.57 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
452 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
460 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  35.79 
 
 
557 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.59 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.18 
 
 
466 aa  133  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
482 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
551 aa  133  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.75 
 
 
477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  33.43 
 
 
608 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  32.97 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
470 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
577 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
470 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.59 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  28.3 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.86 
 
 
579 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.12 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
515 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  36.01 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 
455 aa  128  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  32.34 
 
 
801 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.37 
 
 
469 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  34.52 
 
 
398 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.36 
 
 
462 aa  126  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
538 aa  126  9e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  35.58 
 
 
456 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.78 
 
 
486 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
463 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
554 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
498 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  32.98 
 
 
586 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  31.83 
 
 
583 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.99 
 
 
461 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
504 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
469 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  29.18 
 
 
648 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  33.44 
 
 
463 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  32.15 
 
 
498 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
406 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  31.76 
 
 
484 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  31.76 
 
 
484 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
494 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  31.76 
 
 
436 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  31.21 
 
 
483 aa  124  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
579 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
456 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  34.66 
 
 
450 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
469 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  35.82 
 
 
566 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  30.99 
 
 
443 aa  123  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  33.01 
 
 
455 aa  123  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
465 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>