More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0344 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 479 aa  944    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.55 
 
 		 491 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  45.51 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  46.44 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.94 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  39.34 
 
 		 566 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  42.41 
 
 		 542 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  39.07 
 
 		 524 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  40.55 
 
 		 471 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  37.12 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 449 aa  187  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 675 aa  186  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  36.52 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 526 aa  179  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 523 aa  179  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  32.49 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  37.37 
 
 		 529 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  42.7 
 
 		 451 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 482 aa  156  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.14 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  31.58 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.63 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 469 aa  143  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.6 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  31.98 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.12 
 
 		 490 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.06 
 
 		 466 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 471 aa  133  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  23.12 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 471 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 490 aa  126  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  30.16 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.64 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.57 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.86 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  26.27 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 455 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  28.39 
 
 		 449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  31.15 
 
 		 455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.07 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.78 
 
 		 456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.35 
 
 		 453 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 389 aa  120  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  32.65 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  32.18 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  32.8 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.36 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.12 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  30.92 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.33 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  28.45 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.03 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 613 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.98 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 435 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 458 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>