More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5391 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  100 
 
 		 542 aa  1089    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  60.48 
 
 		 524 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  41.92 
 
 		 471 aa  332  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.4 
 
 		 478 aa  309  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  50.57 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  39.41 
 
 		 498 aa  296  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 484 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  42.52 
 
 		 449 aa  290  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  39.66 
 
 		 476 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  49.7 
 
 		 472 aa  276  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 		 482 aa  276  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 515 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  40.31 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 675 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.05 
 
 		 526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  43.21 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  49.33 
 
 		 529 aa  221  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 479 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 491 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  49.25 
 
 		 451 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  39.3 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  38.98 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.42 
 
 		 486 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.26 
 
 		 481 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 310 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  29.87 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.95 
 
 		 477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  37.95 
 
 		 423 aa  147  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.23 
 
 		 461 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.27 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 463 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  38.43 
 
 		 369 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.56 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.92 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 352 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.04 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.33 
 
 		 512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.66 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  32.86 
 
 		 470 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 614 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  34.25 
 
 		 466 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 815 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.25 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  32.59 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 477 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 507 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  36.46 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  36.88 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  37.55 
 
 		 257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.8 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 501 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  30.88 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  36.36 
 
 		 517 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 575 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.01 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.18 
 
 		 370 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.01 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 457 aa  133  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.53 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.680931  hitchhiker  0.00537944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  33.23 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>