More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2750 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 432 aa  842    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.46 
 
 		 461 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.65 
 
 		 477 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 524 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3034  histidine kinase  30.18 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154589 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  31.56 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  28.22 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.67 
 
 		 464 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 478 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  37.8 
 
 		 478 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 		 675 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  28.13 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  32.52 
 
 		 472 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 509 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.44 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  26.65 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  25.98 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 469 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 469 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2123  sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  26.72 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 526 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 447 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  30.02 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.62 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.99 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.33 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  25.12 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  24.64 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 467 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 477 aa  113  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.04 
 
 		 490 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.77 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0643  histidine kinase  29.91 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  24.42 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2618  histidine kinase  34.31 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0778268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 474 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  26.9 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  27.76 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  32.75 
 
 		 542 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  34.15 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  29.8 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 440 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000024219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  29.53 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  33.22 
 
 		 583 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 502 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  28.12 
 
 		 474 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 455 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  31.18 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.22 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  26.68 
 
 		 524 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 486 aa  107  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  28.13 
 
 		 476 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  31.83 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1560  ATPase domain-containing protein  31.92 
 
 		 486 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.49 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  24.94 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  31.23 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  26.32 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3535  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>