More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0920 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  978    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  49.04 
 
 		 451 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  36.19 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  36.19 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  33.62 
 
 		 455 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  33.33 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2618  histidine kinase  34.41 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0778268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  29.92 
 
 		 456 aa  213  7.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  29.89 
 
 		 460 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0731  histidine kinase  31.22 
 
 		 455 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 467 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  30.27 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  29.3 
 
 		 456 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  27.24 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  28.66 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  29.16 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  27.27 
 
 		 459 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.68 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  31.41 
 
 		 472 aa  146  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 462 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.24 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.69 
 
 		 466 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  31.21 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  31.01 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.08 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 502 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.67 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 487 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  31.72 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1810  histidine kinase  24.43 
 
 		 450 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  32.13 
 
 		 476 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  33.99 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  34.54 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  31.43 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 478 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 464 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 465 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  29.59 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.74 
 
 		 461 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  32.56 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  32.08 
 
 		 583 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  33.65 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 475 aa  123  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.67 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  29.81 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  32.97 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  31.13 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  27.78 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.34 
 
 		 468 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  28.91 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 474 aa  120  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 486 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  30.03 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  29.64 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  29.81 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  24.38 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  28.48 
 
 		 592 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  30.46 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  33.08 
 
 		 454 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  28.06 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  33.55 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  33.33 
 
 		 489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.25 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>