More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4292 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 451 aa  906    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1810  histidine kinase  35.11 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  29.1 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  31.63 
 
 		 460 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  26.05 
 
 		 451 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.6 
 
 		 458 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  27.33 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  25.58 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  26.22 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  26.29 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  25.11 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  34.49 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  26.89 
 
 		 456 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  25.81 
 
 		 455 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0731  histidine kinase  27.51 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  26.52 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  24.13 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  22.89 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  28.97 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.8 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.48 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  26.74 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.79 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  25.57 
 
 		 386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  26.48 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 500 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2618  histidine kinase  23.64 
 
 		 462 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0778268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  25.62 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  25.49 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4714  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  24.57 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  25 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3687  histidine kinase  28.92 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.692162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 477 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  28.09 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 474 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  26.67 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 534 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1213  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29 
 
 		 397 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  22.95 
 
 		 475 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  24.2 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.45 
 
 		 455 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  25.8 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 447 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 455 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  23.23 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  29.67 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  22.62 
 
 		 488 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  24.33 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1131  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 373 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  26.39 
 
 		 508 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.573879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  21.81 
 
 		 583 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 680 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  26 
 
 		 482 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  26.99 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 537 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 453 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  25.68 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.27 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0191  ATPase domain-containing protein  30.73 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>