More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4792 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 534 aa  1055    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  66.81 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  51.38 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  47.53 
 
 		 508 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  45.76 
 
 		 583 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 		 513 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  41.18 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  42.01 
 
 		 508 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  45.37 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  50.15 
 
 		 537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 501 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  38.43 
 
 		 469 aa  291  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  36.25 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  36.51 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7131  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 513 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 544 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  42.51 
 
 		 516 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  40.86 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  38.31 
 
 		 481 aa  170  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 469 aa  170  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  30.08 
 
 		 463 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  38.3 
 
 		 460 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  37.54 
 
 		 506 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  32.41 
 
 		 503 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 460 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 509 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.97 
 
 		 490 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 515 aa  153  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 524 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 524 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.65 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 455 aa  151  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  34.23 
 
 		 486 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 		 482 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  35.48 
 
 		 496 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.54 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  34.78 
 
 		 405 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  35.17 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.29 
 
 		 477 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 461 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 478 aa  146  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  32.52 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  35.66 
 
 		 436 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.64 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 463 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 463 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  31.11 
 
 		 477 aa  144  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  29.28 
 
 		 452 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.08 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  27.41 
 
 		 456 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.85 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.73 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 467 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 513 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  32.98 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 475 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.69 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 513 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 522 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.91 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 310 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 502 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 460 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  34.49 
 
 		 455 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 462 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.71 
 
 		 592 aa  140  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  34.36 
 
 		 425 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  36.2 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>