More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0275 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  935    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  44.13 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  39.43 
 
 		 459 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 467 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  30.99 
 
 		 456 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  32.52 
 
 		 455 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  33.55 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  30.02 
 
 		 460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  31.28 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  28.82 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0731  histidine kinase  30.92 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  29.82 
 
 		 451 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  29.24 
 
 		 455 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  28.79 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  28.48 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  29.3 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  32.13 
 
 		 486 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2618  histidine kinase  27.33 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0778268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1810  histidine kinase  26.2 
 
 		 450 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.43 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 495 aa  139  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 484 aa  136  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.97 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.45 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 452 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  30.51 
 
 		 397 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 525 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  31 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  28.1 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  29.87 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  26.51 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 462 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 524 aa  126  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 504 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 465 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  26.76 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 490 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 509 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  24.63 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  29.37 
 
 		 501 aa  123  9e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 815 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1580  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.6 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00340  signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00418447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.63 
 
 		 497 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  28.36 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.08 
 
 		 469 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 471 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  27.44 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  26.55 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.21 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  27.49 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  32.17 
 
 		 535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 537 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  25.17 
 
 		 489 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  28.15 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.64 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0033  histidine kinase  27.74 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  27.9 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  30.2 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.68 
 
 		 490 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>