More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0352 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
433 aa  870    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  32.71 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
448 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  26.36 
 
 
486 aa  143  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  31.97 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
445 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
445 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
478 aa  136  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  30.25 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  26.96 
 
 
471 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
423 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  30.77 
 
 
472 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.08 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  25.78 
 
 
470 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  24.73 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.88 
 
 
478 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
448 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.88 
 
 
478 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  26.55 
 
 
490 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  30.1 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  26.42 
 
 
405 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
501 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
515 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
433 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
463 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  29.82 
 
 
514 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  29.28 
 
 
456 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  32.71 
 
 
459 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.75 
 
 
515 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 
470 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
481 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
377 aa  123  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  30.14 
 
 
472 aa  123  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  29.04 
 
 
439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
476 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  26.39 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  28.04 
 
 
448 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
463 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
477 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  32.79 
 
 
436 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 
439 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.45 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
455 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.95 
 
 
461 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
469 aa  120  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  27.27 
 
 
473 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
459 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
459 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
459 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  30.62 
 
 
459 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  24.76 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
515 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1823  histidine kinase  38.21 
 
 
319 aa  119  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  28.8 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  30.34 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  32.38 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
474 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  29.17 
 
 
442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  30.23 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
519 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  29.45 
 
 
518 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
477 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
515 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  28.84 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  30.69 
 
 
455 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
486 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.42 
 
 
458 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
517 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
466 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
471 aa  117  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>