More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3738 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  100 
 
 		 467 aa  948    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  37.45 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  35.99 
 
 		 455 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  38.01 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  35.05 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  31.75 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  32.2 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  34.97 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0731  histidine kinase  35.54 
 
 		 455 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  29.59 
 
 		 451 aa  232  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  28.05 
 
 		 456 aa  223  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  29.51 
 
 		 454 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  29.76 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  32.77 
 
 		 458 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 455 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  29.16 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2618  histidine kinase  28.21 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0778268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1810  histidine kinase  27.53 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.12 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.26 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  29.34 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  35.58 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 451 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 438 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  28.22 
 
 		 478 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 455 aa  143  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 452 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  26.25 
 
 		 452 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  33.56 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  31.36 
 
 		 489 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  27.93 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  28.31 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  27.25 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.45 
 
 		 466 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.6 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.86 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.24 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  29.62 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  29.94 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2214  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  31.88 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  29.3 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  33.54 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 475 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 458 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.68 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 500 aa  130  6e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 458 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  29.05 
 
 		 524 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 356 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  28.57 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  30.82 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.79 
 
 		 436 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  26.13 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  31.16 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 462 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.6 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  29.55 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.48 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 477 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>