More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3919 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
455 aa  911    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1810  histidine kinase  33.55 
 
 
450 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1344  ATP-binding region ATPase domain protein  32.39 
 
 
452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
451 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3672  ATP-binding region ATPase domain protein  31.68 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  30.39 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3399  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
467 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  29.39 
 
 
455 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  27.89 
 
 
456 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  29.16 
 
 
460 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  30.65 
 
 
458 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  27.96 
 
 
455 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2734  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
453 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0354974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.21 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0275  histidine kinase  29.22 
 
 
456 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.937393  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  28.61 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3738  histidine kinase  30.54 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351068  normal  0.0242836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0731  histidine kinase  28.91 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
466 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  25.82 
 
 
451 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  35.05 
 
 
469 aa  151  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
459 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.84 
 
 
477 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
469 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
500 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0920  histidine kinase  26.69 
 
 
481 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.651175 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.82 
 
 
469 aa  144  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
469 aa  142  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
495 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  32.55 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.52 
 
 
497 aa  139  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.1 
 
 
486 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32 
 
 
469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  28.66 
 
 
592 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  32.17 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  32.01 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1213  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
472 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.33 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  28.34 
 
 
386 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
462 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
436 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
487 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
490 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
500 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  33.11 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  29.01 
 
 
490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
452 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.15 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
455 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  29.35 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
489 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
465 aa  126  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  28.01 
 
 
489 aa  126  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
466 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  25.85 
 
 
462 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
377 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.17 
 
 
471 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
447 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  29.13 
 
 
448 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
475 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
498 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  31.34 
 
 
473 aa  124  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
509 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  26.15 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  29.76 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  26.15 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  26.74 
 
 
566 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
504 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  32.53 
 
 
490 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.34 
 
 
477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  28.53 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  25.94 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  27.15 
 
 
476 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
476 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  26.82 
 
 
379 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
464 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  27.59 
 
 
398 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  30.77 
 
 
397 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.48 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  29.14 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.93 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  27.67 
 
 
436 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
489 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  27.95 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
471 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.71 
 
 
467 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
501 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 
476 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>