More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2209 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  97.03 
 
 		 471 aa  917    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  100 
 
 		 471 aa  937    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  46.65 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2249  histidine kinase  47.49 
 
 		 463 aa  395  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  39.35 
 
 		 466 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  37.31 
 
 		 491 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  35.51 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 453 aa  256  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 453 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 458 aa  247  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.91 
 
 		 468 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 470 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25.66 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.63 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 459 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 457 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.73 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.21 
 
 		 466 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27.51 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  27.91 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  29.67 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 469 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  30.98 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 639 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 620 aa  163  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 640 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 639 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 639 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 641 aa  161  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  30.62 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  29.75 
 
 		 458 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 484 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 585 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 495 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  25.8 
 
 		 461 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  28.46 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0444  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 613 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0364501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 468 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 587 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 458 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 458 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.15 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 524 aa  156  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 483 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.64 
 
 		 587 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 614 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 607 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  30.52 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 607 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.72 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 600 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  32.51 
 
 		 391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  32.14 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.74 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 467 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 481 aa  153  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 493 aa  152  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 462 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  32.38 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  32.38 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 451 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.53 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.78 
 
 		 587 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  26.67 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  33.85 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  23.55 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>