More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0417 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 495 aa  1029    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1260  Signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000444987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 470 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  28.19 
 
 		 465 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 359 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 487 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 459 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 471 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  36.11 
 
 		 364 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  36.11 
 
 		 364 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 358 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  31.96 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  27.04 
 
 		 466 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  32.92 
 
 		 540 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 		 457 aa  170  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 483 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  26.71 
 
 		 471 aa  169  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 466 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 463 aa  169  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.83 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 641 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  31.38 
 
 		 453 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.57 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13580  signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 613 aa  167  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.111156 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  26.71 
 
 		 471 aa  166  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  24.59 
 
 		 488 aa  166  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  33.04 
 
 		 357 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  35.16 
 
 		 351 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  25.83 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  32.72 
 
 		 508 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  30.94 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  29.34 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  30.79 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  29.64 
 
 		 466 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 458 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 639 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 382 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 458 aa  163  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34 
 
 		 354 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000747291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 		 1207 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2144  sensor histidine kinase  31.59 
 
 		 429 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.49 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 347 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.63 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 351 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 468 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 458 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.87 
 
 		 503 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 458 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 383 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 639 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.59 
 
 		 1133 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.02 
 
 		 467 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  27.2 
 
 		 496 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  27.53 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.86 
 
 		 461 aa  156  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  35.97 
 
 		 253 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  26.32 
 
 		 755 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  25.38 
 
 		 491 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 469 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.14 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 639 aa  154  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 480 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>