More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0800 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 403 aa  811    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  38.06 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  43.36 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  39.16 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 392 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 416 aa  209  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 457 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  38.81 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  40.89 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  40.36 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  30.34 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  38.81 
 
 		 416 aa  202  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 475 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  32.8 
 
 		 436 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  29.19 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  29.19 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1235  histidine kinase  35 
 
 		 434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.14404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  37.5 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  29.49 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  38.62 
 
 		 463 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  39.74 
 
 		 490 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  36.33 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  41.28 
 
 		 481 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2302  histidine kinase  33.86 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03600  histidine kinase  32.94 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0707295 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 504 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 477 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  36.36 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 444 aa  163  4.0000000000000004e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  27.78 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10540  histidine kinase  35.71 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  39.48 
 
 		 477 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 504 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 476 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  39.75 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0737  histidine kinase  37.9 
 
 		 455 aa  159  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00375027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  37.22 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 466 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 608 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  36.43 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0984  sensor histidine kinase CiaH  35.74 
 
 		 437 aa  156  8e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.805926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 454 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1659  histidine kinase  34.93 
 
 		 433 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.455173  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  38.77 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  36.44 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 609 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  36.44 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  36.44 
 
 		 482 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1209  phosphate regulon sensor protein PhoR  31.72 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  38.84 
 
 		 613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  38.84 
 
 		 613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1140  sensor histidine kinase  33.59 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00613378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37.34 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000304613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1404  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000894019  normal  0.0243022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2980  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000022152  hitchhiker  0.00348527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  36.32 
 
 		 480 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 469 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 473 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 600 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1379  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000050186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 480 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  37.84 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  38.39 
 
 		 613 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 406 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 432 aa  152  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000005048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  36.29 
 
 		 482 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 585 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  38.39 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  38.39 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  38.39 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  37.95 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>