More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3844 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  71.4 
 
 		 472 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  98.94 
 
 		 477 aa  937    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  98.94 
 
 		 477 aa  937    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 		 472 aa  948    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  58.94 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 		 474 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  58.94 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  58.51 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  58.72 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  58.51 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  58.51 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  58.51 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  58.51 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  58.51 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  58.51 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  58.3 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  58.72 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  58.3 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  60 
 
 		 474 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  49.58 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  49.58 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  49.58 
 
 		 483 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  49.38 
 
 		 483 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  49.06 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  47.5 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  48.84 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  46.72 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  46.93 
 
 		 474 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  45.83 
 
 		 478 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  45.24 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  45.4 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  45.62 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  42.92 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.1 
 
 		 481 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  44.65 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  40.46 
 
 		 475 aa  358  9e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  40.51 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  43.2 
 
 		 465 aa  326  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  39.54 
 
 		 480 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  40.91 
 
 		 477 aa  319  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  40.16 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  38.24 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  38.02 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  32.14 
 
 		 628 aa  239  8e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  38.17 
 
 		 239 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  25.07 
 
 		 467 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  35 
 
 		 568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 614 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.92 
 
 		 584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  31.47 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.47 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.2 
 
 		 486 aa  124  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 474 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 614 aa  123  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.58 
 
 		 467 aa  123  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.17 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.27 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  28.7 
 
 		 490 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  31.96 
 
 		 356 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 592 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 466 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 637 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  30.51 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 639 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 564 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.76 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  28.77 
 
 		 616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  28.77 
 
 		 616 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  33.03 
 
 		 628 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 549 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367472  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  33.79 
 
 		 347 aa  117  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 581 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 381 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  27.29 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.46 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 412 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 489 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.79 
 
 		 537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 473 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.96 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.15 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.48 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.15 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.15 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 582 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>