More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4840 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04275  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CreB or PhoB, regulator of the CreBC regulon  80.38 
 
 
474 aa  767    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3598  histidine kinase  80.59 
 
 
474 aa  768    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4950  sensory histidine kinase CreC  80.8 
 
 
474 aa  771    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.861306 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4635  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  766    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3657  sensory histidine kinase CreC  80.17 
 
 
474 aa  765    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.958648  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4947  sensory histidine kinase CreC  80.17 
 
 
474 aa  763    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  98.73 
 
 
474 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  98.31 
 
 
474 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04240  hypothetical protein  80.38 
 
 
474 aa  767    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4998  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  766    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  98.73 
 
 
474 aa  945    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  99.16 
 
 
474 aa  951    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  100 
 
 
474 aa  958    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5914  sensory histidine kinase CreC  80.38 
 
 
474 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0560  sensory histidine kinase CreC  72.15 
 
 
474 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0876  sensory histidine kinase CreC  59.79 
 
 
477 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0879  sensory histidine kinase CreC  59.79 
 
 
477 aa  544  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3844  sensory histidine kinase CreC  59.36 
 
 
472 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  60.64 
 
 
472 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  48.23 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  48.23 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  48.23 
 
 
483 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  48.56 
 
 
481 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  47.81 
 
 
483 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4119  sensory histidine kinase CreC  50.63 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06070  sensory histidine kinase CreC  47.41 
 
 
474 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0120862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0569  sensory histidine kinase CreC  47.26 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1651  sensory histidine kinase CreC  45.28 
 
 
481 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5195  sensory histidine kinase CreC  44.86 
 
 
472 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.251392  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0361  sensory histidine kinase CreC  47.38 
 
 
478 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.261479  normal  0.160502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  45.55 
 
 
474 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0358  sensory histidine kinase CreC  46.33 
 
 
478 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0976606  normal  0.775768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4870  sensory histidine kinase CreC  45.38 
 
 
477 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.678033  normal  0.269402 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  43.07 
 
 
481 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1205  sensory histidine kinase CreC  43.58 
 
 
486 aa  348  9e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201777  normal  0.0331356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
476 aa  335  1e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0236  sensory histidine kinase CreC  44.33 
 
 
465 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0317  sensory histidine kinase CreC  42.32 
 
 
483 aa  318  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  39.16 
 
 
475 aa  316  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  39.49 
 
 
478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1316  sensory histidine kinase CreC  39.51 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5424  sensory histidine kinase CreC  38.28 
 
 
486 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0026  sensory histidine kinase CreC  36.46 
 
 
480 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0136  sensory histidine kinase CreC  38.84 
 
 
494 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100988  normal  0.318639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0965  sensory histidine kinase CreC  31.81 
 
 
628 aa  231  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000960861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04742  sensor protein CreC  39.65 
 
 
239 aa  140  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.43 
 
 
469 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
467 aa  119  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.79 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  26.63 
 
 
466 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.96 
 
 
466 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  27.11 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
489 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  23.08 
 
 
456 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
458 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
468 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.89 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0845  histidine kinase  34.27 
 
 
456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000238884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
475 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
469 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  24.85 
 
 
466 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
456 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
468 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  30.42 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.7 
 
 
397 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
442 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
377 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
556 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  30 
 
 
381 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
442 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000310244  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
486 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
369 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  24.32 
 
 
466 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
606 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
439 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  30.69 
 
 
494 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
470 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
581 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
494 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  31.09 
 
 
482 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  34.7 
 
 
412 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  31.31 
 
 
322 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  33.94 
 
 
369 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
448 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  31.05 
 
 
571 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
474 aa  106  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  30.32 
 
 
975 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.87 
 
 
468 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  32.79 
 
 
486 aa  106  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>