More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1802 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  100 
 
 
482 aa  947    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
487 aa  329  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.36 
 
 
473 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  40.84 
 
 
475 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
486 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
518 aa  247  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  48.52 
 
 
486 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
497 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
491 aa  225  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  34.52 
 
 
481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  32.25 
 
 
517 aa  206  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
494 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
475 aa  193  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  30.57 
 
 
460 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
460 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  30.57 
 
 
475 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
475 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
475 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
475 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  30.57 
 
 
475 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
475 aa  191  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  27.61 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
484 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  30.08 
 
 
477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
477 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
478 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  29.72 
 
 
477 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  29.3 
 
 
478 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  29.3 
 
 
475 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
478 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
488 aa  167  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
518 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 
515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  28.69 
 
 
506 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
495 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  28.84 
 
 
478 aa  156  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
483 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  29.74 
 
 
469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
494 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  34.58 
 
 
494 aa  136  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
640 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
639 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
614 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
595 aa  117  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
627 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
592 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  30.87 
 
 
381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
614 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1352 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3601  alginate biosynthesis sensor protein KinB  35.53 
 
 
626 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
839 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  31.79 
 
 
343 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  31.77 
 
 
474 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2352  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.116612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
953 aa  110  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  31.96 
 
 
593 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
389 aa  110  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
799 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
444 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  27.74 
 
 
429 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
965 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  29.19 
 
 
508 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
389 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 
639 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
723 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0288  histidine kinase  28.57 
 
 
432 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000409515  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  31.41 
 
 
474 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
442 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  31.41 
 
 
474 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
597 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  31.41 
 
 
474 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
640 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
442 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
469 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  25.57 
 
 
473 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.66 
 
 
310 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
885 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
431 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1481  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
418 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
466 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
431 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.15 
 
 
620 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
359 aa  106  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0082  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
837 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  27.33 
 
 
363 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
458 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  27.76 
 
 
485 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  35.24 
 
 
556 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
1291 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
429 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
471 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  27.54 
 
 
354 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>