More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2496 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  985    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 		 491 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 518 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 496 aa  340  4e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  37 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 515 aa  273  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 506 aa  272  9e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  33.12 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 494 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 487 aa  247  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  36.14 
 
 		 475 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 495 aa  236  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 482 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 473 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 486 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 473 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  31.39 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  31.39 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  31.39 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  31.39 
 
 		 475 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  42.59 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 478 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  31.01 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  30.44 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  31.65 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 478 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  30.51 
 
 		 478 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  30.51 
 
 		 475 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 614 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  28.44 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 639 aa  133  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 613 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 640 aa  127  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 614 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  32.78 
 
 		 505 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 639 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 638 aa  123  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 631 aa  123  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 620 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  26.57 
 
 		 508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1479 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 1207 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 839 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 595 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 500 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 493 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 1162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 641 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 719 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 490 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  24.64 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  29.21 
 
 		 328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 607 aa  114  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1216  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1194 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.469894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  30 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 620 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 359 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 470 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 389 aa  113  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1100  histidine kinase  35.08 
 
 		 461 aa  113  9e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.26 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 845 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 953 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 484 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1137 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1010 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  28.15 
 
 		 343 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1037 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.62 
 
 		 1137 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1857 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  24.91 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  24.91 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 1146 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  28.62 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 829 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 711 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>