More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4270 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  100 
 
 		 511 aa  1025    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 497 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 517 aa  256  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  33.95 
 
 		 481 aa  249  7e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 491 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 487 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 506 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 473 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 473 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  29.53 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 484 aa  190  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 518 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  35 
 
 		 486 aa  187  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  28.07 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  28.07 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  28.07 
 
 		 460 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  28.07 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  28.07 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 475 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 478 aa  170  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 475 aa  170  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  33.68 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  33.68 
 
 		 475 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  27.48 
 
 		 477 aa  160  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  26.06 
 
 		 477 aa  160  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  27.88 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 488 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 640 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  32.21 
 
 		 508 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  30.64 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 639 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.57 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  29.29 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 466 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 467 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 638 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  25.93 
 
 		 469 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 631 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.7 
 
 		 466 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 349 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 466 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  28.4 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.572616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 466 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 595 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 839 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 614 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 3470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1409  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 639 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 456 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 829 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 571 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 641 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 815 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 459 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 1010 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1039 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  27.18 
 
 		 354 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 843 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 884 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 473 aa  114  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  30.47 
 
 		 461 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  30.56 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 356 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  25.6 
 
 		 518 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 462 aa  113  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  32.56 
 
 		 906 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  30.86 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>