More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0783 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 491 aa  988    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  45.4 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 		 518 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  41.86 
 
 		 481 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 506 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 517 aa  295  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 494 aa  268  2e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 487 aa  256  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  36.62 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 495 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 473 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 518 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 477 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  33.56 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  33.56 
 
 		 475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 475 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  33.56 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  30.74 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  33.75 
 
 		 478 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  32.35 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 478 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  32.35 
 
 		 475 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  31.48 
 
 		 477 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  39.85 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 483 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 467 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 620 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 639 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  34.33 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 639 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 494 aa  137  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 1039 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 467 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 1010 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  28.43 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 1042 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 641 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 613 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 640 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  29.94 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  28.09 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 		 349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 682 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  29.39 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  26.58 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 614 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  28.67 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  33.9 
 
 		 352 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 483 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 631 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  33.9 
 
 		 465 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 453 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.67 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  29.87 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 1741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  33.2 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  34.51 
 
 		 549 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  26.97 
 
 		 491 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  23.27 
 
 		 485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  34.8 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 378 aa  127  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 487 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 1207 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 384 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 815 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004384  phosphate regulon sensor protein phoR  28.52 
 
 		 402 aa  126  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 585 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 593 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.66 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2117  histidine kinase  32.93 
 
 		 631 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>