More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0715 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
518 aa  1041    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  44.59 
 
 
475 aa  340  4e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  44.59 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  44.59 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  44.59 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  44.59 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  44.59 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 
475 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
478 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  43.89 
 
 
460 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  43.89 
 
 
460 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  42.37 
 
 
477 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  40.3 
 
 
477 aa  320  5e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  42.02 
 
 
478 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.02 
 
 
478 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  42.02 
 
 
475 aa  309  8e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  39.83 
 
 
478 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
483 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
467 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
496 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
496 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
518 aa  243  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
497 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  35.07 
 
 
481 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
491 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
517 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  34.69 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
487 aa  209  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
484 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  34.25 
 
 
475 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
473 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  28.11 
 
 
511 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
486 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
494 aa  172  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  37.45 
 
 
486 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  29.4 
 
 
482 aa  161  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
495 aa  153  8e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
488 aa  136  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
494 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  30.64 
 
 
494 aa  115  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
595 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
519 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
2783 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  31.12 
 
 
555 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  30.08 
 
 
617 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
874 aa  107  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
381 aa  106  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  28.83 
 
 
531 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  31.01 
 
 
464 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  30.06 
 
 
508 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
958 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
792 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3958  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
699 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508028  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3217  Cache sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
699 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  30.49 
 
 
461 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  32.47 
 
 
423 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  24.83 
 
 
391 aa  104  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0087  histidine kinase  25.62 
 
 
369 aa  104  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00115186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1328  histidine kinase  32.39 
 
 
672 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
775 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
487 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.3 
 
 
1046 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
500 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 
1010 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  28.57 
 
 
598 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
3470 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  30.08 
 
 
461 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 
1130 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
1207 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  30.08 
 
 
461 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.9 
 
 
601 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
631 aa  101  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1340  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
682 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.725746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  25 
 
 
357 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1195 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
932 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
467 aa  100  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
359 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2340  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000561897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  29.8 
 
 
774 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2563  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0187455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2301  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  26.56 
 
 
501 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2616  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
385 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3128  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
680 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
1479 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
633 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2992  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
680 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1158  histidine kinase  27.7 
 
 
310 aa  97.8  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0534  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
697 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608337  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
871 aa  97.8  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  26.52 
 
 
480 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
835 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>