More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2630 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  100 
 
 		 555 aa  1119    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  35.04 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 		 945 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 307 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 		 608 aa  163  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  37.75 
 
 		 662 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  33.72 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 917 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  37.89 
 
 		 903 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  36.44 
 
 		 927 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 423 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 599 aa  154  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 919 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  36.68 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  35.81 
 
 		 598 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 596 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 571 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  30.13 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 953 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 607 aa  150  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 608 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 609 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 606 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 584 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2650  ATP-binding region ATPase domain protein  38.36 
 
 		 913 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 584 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1415  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 514 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1305  sensor histidine kinase  30.69 
 
 		 514 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179745  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 901 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 514 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 932 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 633 aa  144  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 623 aa  144  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 444 aa  143  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 815 aa  143  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 582 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 585 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 619 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 401 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  33.78 
 
 		 613 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  33.78 
 
 		 613 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  31.69 
 
 		 568 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  35.59 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 611 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 571 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 839 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 493 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 827 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  33.33 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  36 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  32.23 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  33.33 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  33.33 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 376 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 592 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  33.33 
 
 		 613 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.91 
 
 		 346 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 377 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 600 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  37.65 
 
 		 347 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 456 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 475 aa  137  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 1124 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  34.67 
 
 		 919 aa  136  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 487 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 608 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02220  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 774 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  32.3 
 
 		 599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 645 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 729 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 592 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  33.03 
 
 		 455 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 590 aa  135  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  33.18 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 763 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 885 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  33.86 
 
 		 352 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 944 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 351 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 730 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  36.52 
 
 		 910 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  37.61 
 
 		 1071 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  37.61 
 
 		 1071 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 920 aa  133  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>