More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01721 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01721  two-component system sensor kinase  100 
 
 		 469 aa  944    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1601  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.15 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3041  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0516551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3051  histidine kinase  32.83 
 
 		 478 aa  213  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2770  histidine kinase  31.97 
 
 		 477 aa  210  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1083  histidine kinase  33.69 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  32.1 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  32.1 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 475 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  30.91 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  30.91 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3627  two-component system sensor kinase  34.04 
 
 		 475 aa  199  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 478 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1150  putative sensor-like histidine kinase YfhK  34.04 
 
 		 478 aa  199  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  29.35 
 
 		 517 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0783  Signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 491 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 484 aa  160  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 496 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 496 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 506 aa  155  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2496  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 497 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275825  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4270  sensor histidine kinase  25.93 
 
 		 511 aa  146  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1802  sensor histidine kinase  29 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.580207  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3374  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1119  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  31.75 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 495 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 381 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 572 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 3470 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25.58 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 585 aa  99  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  26.68 
 
 		 905 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 524 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  29.9 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0907  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  24.26 
 
 		 500 aa  96.7  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 463 aa  96.7  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  26.52 
 
 		 463 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  30.14 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.48 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  29.8 
 
 		 497 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 638 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 911 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 902 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  30.16 
 
 		 405 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 368 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 907 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.657625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  30.8 
 
 		 895 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 894 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  30.8 
 
 		 894 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  30.8 
 
 		 894 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  31.28 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  26.64 
 
 		 381 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.12 
 
 		 1301 aa  91.3  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.4 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 829 aa  91.3  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.572947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 463 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  30.34 
 
 		 347 aa  90.9  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 885 aa  90.1  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 		 463 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 460 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  27.33 
 
 		 485 aa  90.1  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 489 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 463 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  27.03 
 
 		 907 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 905 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 912 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0352  Signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 361 aa  89.7  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  29.17 
 
 		 465 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6694  putative two-component system histidine kinase  27.95 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 462 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 595 aa  89  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 979 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 905 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>