More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0464 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  1026    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 892 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.9 
 
 		 895 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 888 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  30.93 
 
 		 885 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  30 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.61 
 
 		 910 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 530 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 905 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 889 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 895 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 901 aa  191  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 912 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 902 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 902 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 890 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 905 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 907 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 967 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0751  sensor protein KdpD  29.46 
 
 		 894 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0811  sensor protein KdpD  29.46 
 
 		 894 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00623216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0764  sensor protein KdpD  29.46 
 
 		 894 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0825  sensor protein KdpD  29.46 
 
 		 894 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0325382 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  29.9 
 
 		 895 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 900 aa  179  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  30.13 
 
 		 905 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 902 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 907 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  29.98 
 
 		 907 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 907 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2290  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 951 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.014043  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0861  sensor protein KdpD  28.82 
 
 		 905 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  28.54 
 
 		 908 aa  173  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 902 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  28.4 
 
 		 908 aa  172  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  27.73 
 
 		 894 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  27.73 
 
 		 894 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  27.73 
 
 		 894 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  27.73 
 
 		 894 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  27.73 
 
 		 895 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 894 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  27.54 
 
 		 894 aa  170  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3385  two-component sensor kinase KDPD transcription regulator protein  30.41 
 
 		 937 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 897 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  41.33 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 944 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  27.81 
 
 		 908 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  27.73 
 
 		 894 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  28.74 
 
 		 902 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 897 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  37.8 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  29.98 
 
 		 906 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  27.91 
 
 		 897 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 944 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  27.68 
 
 		 895 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 883 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 887 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 		 887 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 945 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  27.9 
 
 		 905 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  29.54 
 
 		 1035 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 945 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 356 aa  163  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 947 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 947 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 947 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  29.48 
 
 		 914 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  42.36 
 
 		 884 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2050  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 887 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.296359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3270  Osmosensitive K channel His kinase sensor  28.99 
 
 		 938 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0288  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 891 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.399581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 947 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  28.82 
 
 		 915 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 951 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3592  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 938 aa  156  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 884 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 884 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2245  sensor protein KdpD  38.3 
 
 		 887 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  26.31 
 
 		 505 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  28.57 
 
 		 954 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  28.57 
 
 		 954 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  28.57 
 
 		 993 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  29.26 
 
 		 913 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  28.57 
 
 		 993 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  28.57 
 
 		 993 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  36.82 
 
 		 886 aa  154  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 579 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 		 884 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  27.95 
 
 		 909 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  27.79 
 
 		 910 aa  152  8.999999999999999e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 949 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  29.26 
 
 		 902 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.699413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 899 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 541 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  38.5 
 
 		 874 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 896 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  38.89 
 
 		 885 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>