More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4726 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4726  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
368 aa  744    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0650  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0629  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.67365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2452  histidine kinase  32.8 
 
 
366 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
408 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2109  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
408 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1740  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  28.02 
 
 
667 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
396 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
442 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3583  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
397 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
912 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
375 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  36.11 
 
 
373 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03779  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  32.46 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.601764  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
375 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3854  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3774  PAS  35.47 
 
 
395 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.195933  normal  0.315596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
370 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  34.7 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
460 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
621 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
544 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
734 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
373 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  37.39 
 
 
405 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  37.67 
 
 
405 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  34.52 
 
 
725 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  35.65 
 
 
373 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  37.67 
 
 
405 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
446 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.95 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0172  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  33.79 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
595 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.48 
 
 
394 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
618 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1605  sensory box histidine kinase  36.05 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  25.32 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  26.76 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  34.08 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  28.42 
 
 
519 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5176  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
570 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0247  ATPase domain-containing protein  32.91 
 
 
628 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
902 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
509 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
768 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
393 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
469 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
1010 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
549 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  34.25 
 
 
376 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
770 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  35.78 
 
 
471 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  32.88 
 
 
306 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
810 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  33.47 
 
 
380 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
422 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4152  histidine kinase  23.94 
 
 
662 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
1084 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
1548 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
768 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
837 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
768 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
768 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
358 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
522 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
827 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
377 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
389 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  26.43 
 
 
666 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
416 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  31.94 
 
 
373 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  25.42 
 
 
377 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
799 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  32.93 
 
 
894 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  32.93 
 
 
894 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  32.41 
 
 
371 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>