More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_20640 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_20640  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 572 aa  1117    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0698794  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2711  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.2 
 
 		 601 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0394383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2442  histidine kinase  45.27 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000162177 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1241  histidine kinase  48.01 
 
 		 587 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09350  signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.165664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 		 539 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259668  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2513  histidine kinase  44.13 
 
 		 586 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2331  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000623788  decreased coverage  0.00000124143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335096  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1826  histidine kinase  41.62 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 		 575 aa  355  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14760  signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.476011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1434  ATPase domain-containing protein  44.03 
 
 		 544 aa  352  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7593  histidine kinase  41.79 
 
 		 608 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0771  histidine kinase  43.95 
 
 		 594 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3636  ATP-binding region ATPase domain protein  41.33 
 
 		 557 aa  337  5e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1413  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.08 
 
 		 579 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119595  normal  0.0381206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4042  histidine kinase  45.24 
 
 		 594 aa  334  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30930  signal transduction histidine kinase  42.77 
 
 		 577 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13274  two component system sensor transduction histidine kinase mtrB  41.17 
 
 		 567 aa  329  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.620022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 551 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2495  sensor histidine kinase  52.26 
 
 		 579 aa  325  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  38.61 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6309  histidine kinase  52.51 
 
 		 801 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0968  ATPase domain-containing protein  41.6 
 
 		 557 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4248  histidine kinase  41.99 
 
 		 648 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.24223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08600  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 538 aa  306  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.890839  normal  0.98586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0905  histidine kinase  40.89 
 
 		 557 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474957  normal  0.117481 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 		 554 aa  294  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.696871  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0043  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0980006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  40.94 
 
 		 505 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3090  histidine kinase  35.71 
 
 		 482 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  0.680461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.12 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8521  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.22 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0303  sensory box histidine kinase  25.87 
 
 		 616 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4968  sensory box histidine kinase  25.62 
 
 		 609 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.113829  normal  0.750317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  32.05 
 
 		 508 aa  160  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 483 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4563  sensor histidine kinase  25.75 
 
 		 617 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 462 aa  157  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4645  histidine kinase  24.57 
 
 		 620 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  25.44 
 
 		 617 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4936  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4706  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.468527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4545  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 617 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  30.91 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5067  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  27.78 
 
 		 473 aa  153  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.73 
 
 		 503 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2910  histidine kinase  25.57 
 
 		 594 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.07 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  36.39 
 
 		 450 aa  150  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 639 aa  149  9e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 470 aa  146  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4951  sensory box histidine kinase  26.33 
 
 		 617 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  26.67 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  27 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  27 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 639 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 640 aa  144  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 359 aa  144  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 438 aa  144  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 358 aa  143  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  35.31 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.85 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 641 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 504 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1182  histidine kinase  34.24 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  33.91 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  24.81 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  25 
 
 		 456 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 484 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  25.56 
 
 		 484 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 452 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 493 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  32.41 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  32.41 
 
 		 364 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 459 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>