More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0705 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  100 
 
 		 381 aa  758    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  49.84 
 
 		 412 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 445 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  44.05 
 
 		 449 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  44.05 
 
 		 449 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.35 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 419 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  38.1 
 
 		 429 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 		 429 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 		 442 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  47.29 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  43.09 
 
 		 465 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.44 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  43.77 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  43.63 
 
 		 416 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 459 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 455 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  41.33 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  41.27 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 423 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  38.92 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  42.39 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 449 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  38.94 
 
 		 472 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  34.88 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 449 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  37.14 
 
 		 449 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 440 aa  185  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 458 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 455 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 		 444 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  35.14 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  36.82 
 
 		 449 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.03 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  39.09 
 
 		 465 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  36.72 
 
 		 446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  37.25 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 466 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 454 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 457 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 446 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  36 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 448 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 		 445 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 449 aa  162  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 450 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  33.79 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  35.92 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 570 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  39.18 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  39.18 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  34.58 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  31.54 
 
 		 457 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  34.84 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  33.69 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  38.97 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  34.68 
 
 		 462 aa  149  7e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  31.67 
 
 		 446 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  32.45 
 
 		 457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  38.83 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  40.07 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  32.65 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 448 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  35.9 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  25.52 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  33.46 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  35.66 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  33.46 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  33.46 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  33.46 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>