More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3591 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.73 
 
 
446 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  87.78 
 
 
450 aa  802    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  100 
 
 
449 aa  901    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  74.49 
 
 
446 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.05 
 
 
446 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.05 
 
 
446 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.59 
 
 
446 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.09 
 
 
443 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  64.51 
 
 
446 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  66.36 
 
 
445 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  65.45 
 
 
445 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
459 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
454 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
469 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  34.31 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  34.31 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  35.18 
 
 
452 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.68 
 
 
465 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  27.15 
 
 
472 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
421 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
442 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
423 aa  167  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.26 
 
 
412 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.17 
 
 
465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  36.07 
 
 
480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
439 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
455 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  26.49 
 
 
455 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  28.63 
 
 
429 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
570 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  29.91 
 
 
453 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
420 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  36.52 
 
 
416 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 
419 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  33.96 
 
 
453 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 
429 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  32.73 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
435 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
467 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
458 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
463 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
454 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
440 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  27.77 
 
 
458 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.43 
 
 
458 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  31.5 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  28.33 
 
 
462 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
472 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.93 
 
 
449 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 
449 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
463 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
449 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  26.71 
 
 
449 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  33.92 
 
 
456 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.01 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
457 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
466 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  33.33 
 
 
457 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
543 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  32.44 
 
 
471 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
444 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  26.61 
 
 
458 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
448 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
459 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
523 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3428  sensor protein QseC  38.03 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3434  sensor protein QseC  38.03 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3363  sensor protein QseC  38.03 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.987162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  35.26 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3359  sensor protein QseC  38.03 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3529  sensor protein QseC  38.03 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  26.93 
 
 
449 aa  133  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.22 
 
 
365 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  34.94 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0736  histidine kinase  30.65 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  35.98 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  33.22 
 
 
422 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.22 
 
 
566 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  36.82 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  33.45 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  27.75 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  34.15 
 
 
422 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
448 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>