More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2624 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
435 aa  884    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  37.7 
 
 
472 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
469 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.78 
 
 
452 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
454 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 
449 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
458 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  37.78 
 
 
458 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  39.36 
 
 
449 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
449 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
389 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  38.78 
 
 
449 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
458 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
454 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
467 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
449 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
445 aa  186  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  29.07 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  37.33 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.41 
 
 
471 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  36.45 
 
 
449 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.36 
 
 
465 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  36.45 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
449 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  34.01 
 
 
381 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  39.06 
 
 
453 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  35.64 
 
 
453 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
455 aa  172  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
442 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  34.52 
 
 
462 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  37.63 
 
 
412 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  35.74 
 
 
429 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
455 aa  168  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  34.32 
 
 
468 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  34.43 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  35.69 
 
 
480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  32.13 
 
 
465 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  34.62 
 
 
468 aa  164  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
449 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  32.72 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  35.81 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.98 
 
 
456 aa  163  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  34.69 
 
 
464 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  28.73 
 
 
446 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  31.11 
 
 
445 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
446 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
455 aa  158  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  33.23 
 
 
457 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
450 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  31.14 
 
 
416 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
444 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  30.94 
 
 
445 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.76 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  36.33 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000076955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  33.46 
 
 
456 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
449 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
446 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
446 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  33.93 
 
 
469 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
445 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
471 aa  150  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  33.46 
 
 
456 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  33.82 
 
 
456 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  33.21 
 
 
461 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  33.09 
 
 
457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  33.46 
 
 
456 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  32.72 
 
 
457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  32.72 
 
 
457 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2706  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  32.54 
 
 
453 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.84 
 
 
365 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 
446 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
428 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
469 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  32.35 
 
 
457 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
458 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
425 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>