More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1803 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.79 
 
 
446 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  100 
 
 
450 aa  901    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.79 
 
 
446 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  87.78 
 
 
449 aa  802    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  74.77 
 
 
446 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.79 
 
 
446 aa  646    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.56 
 
 
446 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.2 
 
 
443 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  65.77 
 
 
446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  66.67 
 
 
445 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  66.21 
 
 
445 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
445 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
454 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
389 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
449 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.74 
 
 
449 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.74 
 
 
449 aa  179  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
421 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  32 
 
 
465 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
469 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  30.2 
 
 
429 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
439 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
420 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
419 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  28.76 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
458 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.94 
 
 
472 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  38.8 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  34.2 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
423 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
429 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.88 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  28.32 
 
 
449 aa  163  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
458 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  35.71 
 
 
480 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  35.03 
 
 
381 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  33.96 
 
 
453 aa  162  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  27.09 
 
 
455 aa  162  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  26.87 
 
 
455 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  29.87 
 
 
453 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.26 
 
 
471 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
435 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.49 
 
 
416 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
449 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  28.54 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
466 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
455 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
455 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  34.52 
 
 
456 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
570 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  33.02 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  31.8 
 
 
457 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  26.75 
 
 
458 aa  146  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
467 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
543 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
455 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
440 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
459 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  30.72 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.42 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  27.29 
 
 
458 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  33.86 
 
 
457 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
463 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
426 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  36.39 
 
 
408 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
472 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3185  ATPase domain-containing protein  36.36 
 
 
422 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00240847  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 
427 aa  137  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
427 aa  136  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000439067  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
422 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000233737  normal  0.0772482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 
457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000317238  normal  0.345558 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
433 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
523 aa  133  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  34.1 
 
 
566 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
422 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000859789  normal  0.518729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
448 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3428  sensor protein QseC  36.91 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3359  sensor protein QseC  36.91 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3363  sensor protein QseC  36.91 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.987162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3529  sensor protein QseC  36.91 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3434  sensor protein QseC  36.91 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0877  histidine kinase  32.03 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000773434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  31.74 
 
 
365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3595  sensor protein RstB, putative  34.83 
 
 
440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021022  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  34.4 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  27.81 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>