More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4220 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
472 aa  947    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  67.91 
 
 
458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.94 
 
 
457 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.64 
 
 
463 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.95 
 
 
463 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  54.2 
 
 
443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  54.63 
 
 
445 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  54.83 
 
 
446 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  51.35 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  51.13 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.93 
 
 
448 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.8 
 
 
445 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.92 
 
 
442 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  51.24 
 
 
442 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 
448 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
444 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
471 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
449 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
448 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  29.11 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  39.57 
 
 
381 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.55 
 
 
452 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
465 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
455 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  28.48 
 
 
455 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  28.06 
 
 
449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  28.06 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
449 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
469 aa  149  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
446 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
449 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
442 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.65 
 
 
465 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  33.8 
 
 
456 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  32.89 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  33.57 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
454 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  35.61 
 
 
480 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33.22 
 
 
449 aa  141  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  26.54 
 
 
457 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
449 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
419 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  34.88 
 
 
450 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  36.62 
 
 
446 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
440 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  36.19 
 
 
445 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  35.82 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.99 
 
 
449 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  35.15 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  27.65 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.17 
 
 
471 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  32.61 
 
 
429 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  35.17 
 
 
416 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  35.59 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.17 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  26.74 
 
 
468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
445 aa  131  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
467 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  25.4 
 
 
471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
466 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  32.24 
 
 
453 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  27.18 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
429 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
433 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
459 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
455 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.42 
 
 
1162 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
443 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
435 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
454 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  31.02 
 
 
456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  34.42 
 
 
469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  32.07 
 
 
464 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
570 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.14 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.77 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
458 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
453 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  33.33 
 
 
438 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  33.68 
 
 
365 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>