More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1224 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 563 aa  1157    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.26 
 
 		 554 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00056793  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 389 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 454 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  29.45 
 
 		 452 aa  144  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  33.77 
 
 		 449 aa  143  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  33.77 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  28.3 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  30.06 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  32.47 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 420 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.22 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  33.12 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  33.22 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  32.79 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 449 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  30.25 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 462 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 429 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  31.32 
 
 		 457 aa  134  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  34.15 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  30.96 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  34.1 
 
 		 412 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 442 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4275  two-component sensor protein  31.45 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4061  two-component sensor protein  31.8 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000114618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4345  two-component sensor protein  31.45 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000360495 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4389  two-component sensor protein  31.45 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4304  two-component sensor protein  31.45 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4456  two-component sensor protein  31.45 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.874205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  30.87 
 
 		 453 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  34.02 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  32.87 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  30.67 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  32.75 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  32.64 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  32.64 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  32.64 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  29.18 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 445 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  26.53 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  32.17 
 
 		 456 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 449 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 446 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  30.07 
 
 		 461 aa  126  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  32.15 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 440 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  28.3 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  30.98 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.67 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  32.17 
 
 		 456 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 464 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3178  sensory box histidine kinase VicK, putative  25.71 
 
 		 615 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 463 aa  124  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0256  sensor histidine kinase  23.49 
 
 		 615 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  28.57 
 
 		 482 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  29.07 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  31.37 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>